学院现设有土木工程、城市地下空间工程、智能建造三个本科专业（1999年交通运输专业和交通工程专业并入土木工程学院，2024年又划转至城市发展与现代交通学院）。
土木工程专业起源于1956年并校时成立工业与民用建筑专业，办学历史悠久、底蕴深厚。1993年，更名为建筑工程专业；1999年，按教育部专业目录更名为土木工程专业；2003年，入选陕西省名牌专业；2008年，入选国家级特色专业；2010年，入选首批教育部“卓越工程师教育培养计划”实施专业；2012年，入选教育部综合改革试点专业；2019年，入选首批国家级“一流本科专业”建设点。土木工程专业已连续五次通过国家专业评估/认证，现有建筑工程、道路与桥梁工程、工程结构改造与更新三个专业方向，其中，2023年开设的“工程结构改造与更新”专业方向（全国首个），为国家急需学科专业领域。
城市地下空间工程专业的办学历史可追溯至1969年开设的地下工程专业；1978年，并入工业与民用建筑专业； 1999年，设立土木工程专业岩土工程方向；2016年，经教育部批准设置城市地下空间工程专业；2017年，入选陕西省“一流本科专业”培育项目；2019年，入选首批国家级“一流本科专业”建设点；2023年，位列校友会中国大学专业排名（研究型）第3名；2024年，位列软科中国大学专业排名第9名、校友会中国大学专业排名（研究型）第1名。
智能建造专业是面向国家战略需求和建筑业转型升级，以土木工程专业为基础，融合电子信息及其自动化、机械设计制造及其自动化、控制科学与工程等专业的“新工科”专业。2020年，土木工程专业下设智能建造专业方向；2023年，经教育部批准设立智能建造专业独立招生。智能建造专业是国家急需学科专业领域专业和陕西省重点产业链专业。
